Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Pkp1P97350 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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