Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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Opn1mwO35599 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Opn1mwO35599 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms