Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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