Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
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