Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprtQ99M80 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
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PtprtQ99M80 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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