Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm42605-201ENSMUST00000199565 385 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm44267-201ENSMUST00000204132 385 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gramd4-201ENSMUST00000088931 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 AC170188.1-201ENSMUST00000223710 1963 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Cnot2-202ENSMUST00000105265 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Nol11-202ENSMUST00000106757 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Mterf4-203ENSMUST00000112944 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Lpin3-202ENSMUST00000109455 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Frk-201ENSMUST00000019913 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Ndrg3-203ENSMUST00000109558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxb4P10284 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms