Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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