Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn2r25W4VSP2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms