Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms