Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms