Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms