Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs4Q9Z1T2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs4Q9Z1T2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms