Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms