Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne6Q9Z140 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms