Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn2Q9Z0R6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itsn2Q9Z0R6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms