Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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