Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sema6cQ9WTM3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms