Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trex2Q9R1A9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trex2Q9R1A9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms