Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms