Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms