Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SrpxQ9R0M3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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