Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms