Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms