Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL0

Hils1, Spermatid-specific linker histone H1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hils1Q9QYL0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hils1Q9QYL0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hils1Q9QYL0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms