Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms