Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms