Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms