Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Trpc5Q9QX29 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Trpc5Q9QX29 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc5Q9QX29 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc5Q9QX29 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc5Q9QX29 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc5Q9QX29 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc5Q9QX29 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc5Q9QX29 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc5Q9QX29 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc5Q9QX29 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc5Q9QX29 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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