Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdcQ9QW08 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdcQ9QW08 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms