Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms