Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b2Q9JME5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b2Q9JME5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms