Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms