Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nectin3Q9JLB9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Nectin3Q9JLB9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms