Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms