Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod2Q9JKK7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmod2Q9JKK7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms