Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Praf2Q9JIG8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms