Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EefsecQ9JHW4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EefsecQ9JHW4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EefsecQ9JHW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EefsecQ9JHW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms