Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clstn2Q9ER65 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms