Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp3a44Q9EQW4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp3a44Q9EQW4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms