Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms