Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp2Q9EPK2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms