Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med27Q9DB40 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms