Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms