Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9DAE8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms