Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms