Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms