Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms