Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms