Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms