Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rep15Q9D7T1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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